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Target-seq—高效高针对性的目标区域捕获测序
- Target-seq也称多重PCR-目标区域，通过多重PCR方法对目标区域进行富集，结合高通量测序和生物信息方法对目标区域进行序 列测定和分析。
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针对性强：
可针对几Kb-200 Kb的基因连续区间、外显子靶标以及客户指定位点进行一次性捕获 -
效率高：
将多重PCR与高通量测序相结合，运用Illumina测序平台，一次可以完成3000个样本检测。
应用方向
癌症疾病
肿瘤、免疫病等研究等。可以用于QTL功能基因挖掘和GWAS候选区间解析，筛选特定染色体区段进行深度测序和变异挖掘研究队列研究
疾病与风险因素、遗传特征等研究。
诺禾优势
1.专业背景强
基于成熟的生物信息分析人才，专业的项目分析，可以根据客户不同要求分析个性化内容-
2.科学方案设计
从材料选取、探针捕获、到检测分析，每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果。特异性
引物设计
DNA提取
>0.6μg
多重PCR目
标区域捕获
文库构建
180-220bp
PE150测序
平均测序
深度1000×
信息分析
信息分析
| 产品 | 分析内容 | |
|---|---|---|
| Target-seq 目标区域捕获技术 |
1. 原始数据整理统计 2. 扩增子测序深度统计 3. SNP、Indel 检测 4. 最小等位基因频率 |
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送样建议
| 样本类型 | 送样建议 |
|---|---|
| 动物组织样本 | >0.5g（不同组织类型需根据实际得率而定） |
| 核酸DNA |
>40ng/μl，10K区域以内体积大于20μl； 每增加10K，DNA体积增加10μl |
| 细胞 | ≥ 5×10 6 |
| 全血 | ≥ 1.5mL |
常见问题
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1. Target-seq可以捕获线粒体DNA吗？
- 可以。对于线粒体DNA的捕获和全基因组是一样的
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2. Target-seq与Sanger测序相比的优势?
- 对于5Kb-200Kb大小的基因片段进行序列捕获时，用Sanger测序需要将大片段分解成小片段逐一扩 增，耗时较 长，而基于超高重PCR的目标区域测序，可以在参考序列的基础上设计特定的引物，经过 引物优化及修饰，多重 PCR一次性捕获所有位点。
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3. 客户可以提供的样本类型有哪些？
- 客户可以提供DNA样本，另外可以接受血液、细胞等。
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4. Target-seq在进行目标区域捕获时，会有重叠序列对数据的干扰吗？
- 在运用多重PCR进行进行目标区域捕获时，会将扩增出重叠序列的相邻引物分别放于两个管中进行目标区域的捕获， 有效避免重叠序列对数据的影响。
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5. 捕获测序必须要有参考基因组吗?
- Target-seq对序列进行捕获的时候需要有参考基因组，这是为了确保捕获结果的可靠性。因为特异性引物是根据提 供的参考序列来设计的，如果待检目标区域与参考基因组有较大出入，例如大片段的插入缺失，会对结果产生影响。
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6. Target-seq可以针对的物种有哪些？
- Target-seq对物种没有限制，可以针对有参物种设计特异性引物，做到成百上千片段同时扩增，成百上千样本同 时建库，最后高通量测序与分析。
拓展材料
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Target-seq：一种高效的目标区域测序技术
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