表观组学(染色质微环境)-项目案例-诺禾致源

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表观组学(染色质微环境)

项目案例一

SET Domain‒Containing Protein 4 Epigenetically Controls Breast Cancer Stem Cell Quiescence

期刊：Cancer Research
影响因子：12.701
发表时间：2019年9月

癌症是目前全球广泛关注的疾病之一。由于肿瘤细胞的异质性，放化疗的疗效通常欠佳。目前的治疗方法因为耐药性癌细胞的出现而受到限制。越来越多的证据表明，休眠的 CSC( 癌症干细胞 ) 对于对抗放化疗治疗和肿瘤复发有重要作用。尽管已经报道了几种调控细胞休眠的分子机制，但对于CSC 中休眠的决定因素以及活跃状态和休眠状态之间转变的机制尚不清楚。

研究结论

研究证明 SETD4 通过 H4K20me3 的催化作用促进了位于特定启动子区的 BCSCs 中异染色质的形成，并在 BCSCs 的静态调节中调节一组基因的表达。该研究为 SETD4-defined qBCSC 促进肿瘤发生和复发的机制提供了指导，对临床治疗具有广泛的意义。

参考文献

Sen, Yan-Fu, Ding, et al. SET Domain-Containing Protein 4 Epigenetically Controls Breast Cancer Stem Cell Quiescence.[J]. Cancer research, 2019, 79(18):4729-4743.

项目案例二

RNA methylomes reveal the m6A-mediated regulation of DNA demethylase gene SlDML2 in tomato fruit ripening

期刊：Genome Biology
影响因子：14.028
发表时间：2019年8月

研究背景

在核酸的甲基化修饰中，DNA 甲基化 (5mC) 和 RNA 甲基化 (m6A) 尤为重要，在基因表达调控中发挥重要作用并参与诸多生物学过程。5mC 已被证实能够参与调控果实成熟，然而，m6A 在果实成熟过程中的作用以及这两种核酸修饰之间是否存在内在关联性尚不清楚。

m6A 甲基化通常与转录本丰度呈负相关

研究结论

该研究初步明确了 DNA 甲基化与 RNA 甲基化之间存在关联性，揭示了果实成熟调控的新机制，为阐明果实成熟调控网络提供了新思路。鉴于 DNA 甲基化和 RNA 甲基化的多重功能，该研究中所呈现的反馈调控机制也适用于其他生物学过程。

参考文献

Zhou L , Tian S , Qin G . RNA methylomes reveal the m6A-mediated regulation of DNA demethylase gene SlDML2 in tomato fruit ripening[J]. Genome Biology, 2019, 20