研究目的

养殖业产生的废弃物是有机肥的重要来源，有机肥中的抗生素抗性基因（ARGs）向土壤和作物迁移，当携带ARGs的蔬菜被人类生食时，ARGs会通过食物链传播至人体肠道菌群，进一步加剧人体抗生素耐药性的风险，威胁人类健康。

该研究通过宏基因组测序与HT-qPCR技术，系统解析了猪粪和羊粪有机肥施用条件下土壤-洋葱系统中ARGs的分布特征与迁移特征。采用LC-MS对根系分泌物中的酚类代谢物进行分析，并结合荧光标记接合转移试验，揭示根系分泌物关键组分对ARGs传播机制的影响。

研究结果

施肥显著促进了ARGs在土壤与洋葱中的富集。与未施肥处理相比，猪粪和羊粪处理组洋葱鳞茎中的ARGs丰度分别提高了4倍和2倍。相较于鳞茎，洋葱根部中的ARGs丰度更高。在土壤和洋葱组织中共检测到11种ARGs，其中包括高风险基因变异体，如tetX和mexE。施肥处理显著改变了洋葱组织中ARGs相关宿主细菌群落的组成。畜禽粪肥类有机肥的施用使鳞茎中ARGs的潜在暴露风险提升超过20%。

此外，从洋葱主要可食用部位（鳞茎）中分离获得了5株多重耐药的内生细菌，涵盖链霉菌属（Streptomyces）和假单胞菌属（Pseudomonas）等。值得注意的是，本研究发现，芸香苷（kaempferol，35–140 μg/L）和对香豆酸（p-coumaric acid，2.5–10 μg/L）能显著促进RP4质粒在洋葱内生菌（如芽孢杆菌属 Bacillus 和解淀粉芽孢杆菌属 Paenibacillus）及土壤微生物群体中的结合转移过程。